Яркой самобытностью отличаются музыкальные инструменты каракалпаков. Среди населения особо популярен дутар — двухструнный щипковый инструмент из дерева, с грушевидным корпусом, покрытым тонкой деревянной декой, с недлинным грифом, снабженный 12 (13) надвязанными ладами. Традиционно его украшают вставками резной кости и перламутра. Дутар отличает мелодичность звучания, он широко популярен среди населения как инструмент, использующийся для домашнего музицирования. В целом же он исконно является атрибутом бахсы (певец лирических поэм), при этом ему аккомпанирует гиржек — трехструнный смычковый музыкальный инструмент с резонатором из скорлупы тыквянки и кожаной декой.
Символом музыкальной культуры каракалпаков считается кобыз — двухструнный смычковый деревянный инструмент с открытым резонатором (его ковшеобразный корпус только наполовину затягивают кожаной декой). Струны инструмента делают из связок конских волос. Кобыз издает матовые «космические» звуки и неотъемлемо сопровождает гортанное пение сказителя эпосов — жырау. Это компактный инструмент, легко вмещаемый в дорожную торбу, он состоит из двух раздельных частей (корпус и гриф), что в древности было связано с кочевым образом жизни сказителя.
Оттенком эха истории обладают духовые инструменты каракалпаков, издающие гармоничное и вместе с тем экзотическое звучание. Среди них — изобретения древних пастухов: деревянная свирель баламан, камышовая флейта камыс най, тростниковая дудка курай, а так же короткая камышовая дудка дудук. Замечателен дуговой варган — шын-гобыз (губно-ротовой инструмент, состоящий из кованого металлического прута и стального язычка). По древнейшему поверью, шаманы, играя на варгане, могли перемещаться по трём мирам, изменяя тембр и тип вибраций.