Les instruments de musique karakalpaks se distinguent par leur originalité. Le plus populaire d’entre eux était le dutar, un instrument en bois à deux cordes pincées, doté d’un corps en forme de poire et d’un manche relativement court. Le dutar dispose de 12 ou 13 frettes nouées et il est recouvert d’une table d’harmonie en bois fin. Traditionnellement, l’instrument est décoré d’os sculptés et d’incrustations de nacre. Il émet un son très mélodieux. Il s’agit d’un instrument très populaire pour jouer de la musique en famille. En général, il est attribué de naissance aux baksi (chanteurs de poèmes lyriques). Le dutar est accompagné d’un girjek, un instrument à trois cordes frottées, équipé d’une caisse de résonance en forme de citrouille et d’une table d’harmonie en cuir.
Le symbole de la culture musicale du Karakalpakistan est le kobyz, un instrument en bois à deux cordes frottées, équipé d’une caisse de résonance ouverte. Son corps en forme de louche est partiellement renforcé par une table d’harmonie en cuir. Les cordes sont fabriquées en crin de cheval. Le kobyz produit des sons « cosmiques » mats et accompagne traditionnellement le chant guttural des conteurs épiques – jirau. Il se compose de deux parties distinctes, le corps et le manche. Il s’agit d’un instrument compact pouvant être facilement transporté dans un sac de voyage, une caractéristique associée dans l’Antiquité au mode de vie nomade du conteur.
Les instruments à vent karakalpaks ont également laissé un léger écho dans l’histoire. Ils émettent un son harmonieux et néanmoins exotique. Parmi les instruments à vent figurent par exemple les inventions des bergers antiques : pipeau en bois – balaman, flûte en roseau – kamis nay, pipeau en roseau – kuray et petit pipeau en roseau – duduk. La guimbarde arquée (shin gobyz) est un instrument lamellophone qui consiste en une tige en métal et une languette en acier. Selon d’antiques croyances, les chamans en mesure de jouer de la guimbarde et de modifier la tonalité et le type de vibration pouvaient voyager à travers trois mondes.