Музей был организован в 1984 году в портовом поселке Учсай и в 1998 году переведен в здание Дома культуры Муйнакского района. Его коллекция, собранная в 80-е гг. доктором О. Есеркеповым, рассказывает об истории Муйнака и Аральского моря. Она представлена национальными костюмами, старинными ювелирными изделиями, предметами быта, лодками и рыболовными снастями, чучелами животных и птиц, а также архивными фотографиями.
Уникальна коллекция живописи 60–70 гг. XX в., представленная живописными картинами художников Рафаэля Матевосяна и Фаима Мадгазина. Их часто называли летописцами Арала, т.к. в своих работах, представляющих историческую и художественную ценность, они поведали о редкой красоте региона и Аральского моря, а также о превращении голубого Арала в пустыню.