Современная коллекция Государственного музея искусств Республики Каракалпакстан имени Игоря Савицкого содержит более 100 тысяч произведений искусства. Это сокровищница, дающая представление о культурном отрезке, начиная с III века до нашей эры. Хронологически коллекция охватывает более четырех тысячелетий!
Первоначальным ядром коллекции Нукусского музея стало древнее и народно-прикладное искусство региона Приаралья, на территории которого сегодня расположен Каракалпакстан. Формирование коллекции под руководством Игоря Витальевича Савицкого началось в конце 1950-х — начале 1960-х годов, до официального учреждения музея. Большая часть предметов декоративно-прикладного искусства Каракалпакстана относится ко второй половине XIX — началу XX века. Среди них можно найти изделия из дерева и кожи, которые использовались кочевыми народами в походах — сёдла, украшенные серебром, футляры для посуды и резные двери для юрты.
Особый интерес представляют ковровые изделия для убранства каракалпакских юрт, узорные полосы для создания которых выполнены с применением уникальной техники рельефного ворсового ткачества. Коллекция также включает богатейшие образцы старинных каракалпакских ювелирных украшений из серебра с вставками из сердолика и бирюзы, а также традиционные головные уборы каракалпачек, такие как тобелик и саукеле.
Национальные костюмы, вышитые шёлком, были созданы руками безымянных народных мастериц, что придаёт этим предметам особую ценность и свидетельствует о высоком уровне художественного мастерства.
Обширная коллекция археологических находок из античных и средневековых городищ наглядно отражает основные этапы культурной истории Каракалпакстана, начиная с эпохи бронзы и заканчивая возникновением древнейших государств, одним из которых был Древний Хорезм. 
Коллекция охватывает период вплоть до раннего средневековья и конца XIV века, когда Хорезм вошел в состав государства Темуридов.
Артефакты, включая древние скульптуры, керамические изделия, ювелирные украшения, рукописи и уникальные фрески, а также зороастрийские терракотовые статуэтки Анахиты — богини плодородия и оссуарии (сосуды для захоронения останков предков огнепоклонников), позволяют глубже понять историю и богатое культурное наследие региона.
Предметы материальной и художественной культуры древнего и средневекового Хорезма, такие как археологические находки из Топрак-калы, Ток-калы, Миздахкана и других мест, служат важными свидетельствами прошлого, дающими представление о жизни и традициях людей, населявших этот уникальный уголок мира. Наиболее древним экспонатом является образец наскальных рисунков — изображение двугорбого верблюда на куске скалы из горной гряды Букантау, датируемое II тысячелетием до н.э. К поздней античности I — IV веков относятся бронзовая булавка в форме руки, держащей яблоко, светильники из бронзы и коллекция керамики, включая хумы для хранения зерна, кувшины и другие изделия, датируемые XII–XIII веками.
Всемирную известность Нукусскому музею принесла коллекция русской авангардной живописи 20-х – 40-х годов XX века. Многие авторы, чьи работы представлены в залах музея, такие как Роберт Фальк, Климент Редько, Любовь Попова и скульптор Вера Мухина, были широко известны в Европе.
В экспозиции музея можно увидеть подлинные шедевры художника А. Волкова и изысканные работы тончайшего стилиста Усто Мумина (А. Николаева), а также ранние произведения известных художников-импрессионистов, живших в Узбекистане, таких как У. Тансыкабаев и Н. Карахан.
Близкие по духу и стилистике авангарду, великолепные полотна В. Рождественского, Е. Коровай, М. Курзина и А. Шевченко также занимают важное место в коллекции.
Музей не только хранит шедевры известных художников, которые сформировали основные художественные направления Центральной Азии в первой половине XX века, но и знакомит зрителей с великолепными произведениями талантливых современных художников Каракалпакстана, среди которых Ж. Изентаев, Б. Серикеев, Р. Матевосян, Ж. Куттымуратов и другие.
Обновлённая экспозиция Государственного музея искусств Республики Каракалпакстан имени И.В. Савицкого «Мир Игоря Савицкого» знаменует собой важную веху в переосмыслении экспозиции музея. Обновленное пространство объединяет живопись, археологию и декоративно-прикладное искусство, подчёркивая беспрецедентный вклад Савицкого в сохранение культурного наследия Приаралья.